古希腊医学主要以意大利半岛东南部地中海沿岸为中心。当时希腊由较多个民族组成，希腊医学除吸收埃及、巴比伦和亚述的医学以外，还有小亚细亚西部的米诺亚（Minoa）民族的医学。米诺亚民族于公元前1000年左右在地中海沿岸繁荣过，据考古学者研究，那是当时一个比较先进的民族，文明程度较高。虽然他们后来被希腊人征服，但是他们的民族文化并没有被消灭，而且对希腊医学产生一定影响。比如米诺亚民族曾经以蛇作为宗教上的一种符号或表征，而希腊人则以蛇作为医学的象征，这就是希腊医学受米诺亚医学影响的一个佐证。此外，米诺亚人使用的一种排水装置，以后发展为希腊医学卫生设施的一部分。

大约到了公元前6世纪，希腊进入发达的奴隶制社会，哲学在希腊得到空前发展。人们力图从哲学角度说明宇宙的本质和来源。很多哲学家都是各科学者，他们从事数学、天文学、地理学等学科的研究，不满于宇宙中的一切都是由神创造的观点，进而寻求比较科学的解释。譬如，比利图人泰勒斯（Thales，约公元前4世纪），认为世界的本源是水，依他的见解，水是一切物质的基础。古希腊哲学家中较著名的还有赫拉克利特（Heracletus，公元前5世纪）；德谟克利特（Democritus，公元前460——前370年）。前者以为火是万物的本源，万物处于永恒的运动变化之中，他有句名言“人不可能两次踏进同一条河流”。他认为宇宙的本质既不是精神，也不是神灵，宇宙是物质的。根据德谟克利特的理西方的医学发展史论，物质是由极小的原子（Atoi）构成的，这些原子在不断运动着，时而结合，时而分离。他用各种原子的离合来解释复杂多变的自然现象，这种观点给予那些“神与宗教主宰一切”的理论以致命打击，因而德谟克利特是一位最出色的、唯物的无神论者。德漠克利待在写信给他同时代的医生希波克拉底时曾说过；“人们用祷告问神求健康，而不知道自己拥有保持健康的方法”。德谟克利特的原子论和唯物主义思想，促进了以后科学的发展。其次，另一位唯物主义哲学家恩培多克勒（Empedocles，约公元前483——前423年），提出一切物体都是由四种元素组成的，即火、空气（风）、水和土（地），这四种元素以不同数量比例混合起来，成为各种性质的物体，与我国的五行学说类似。恩培多克勒是唯物主义哲学家，也是著名的医生。他认为肌肉的形成是由于四种元素等分量的混合，神经由火和土与双倍的水结合而成，动物指甲的形成是神经与空气接触表面受冷的结果。骨格由两分水、两分土和四分火混合而成。汗和泪是由一部分血液变来的，这血液被温度搞得流动性较大、更精细，因而能够流淌出来。希腊哲学家中，出色的还有苏格拉底（Socrates）、柏拉图（P1ato）和亚里斯多德（AristotIe）。

其中亚里斯多德（公元前384——前322年），与医学和生物学有密切关系，他是古代著名学者，许多作品流传至今。亚里斯多德虽然是古代著名思想家，却也未能摆脱奴隶所有者的偏见，极力维护奴隶制度。亚里斯多德17岁时，就成为柏拉图弟子，至公元前347年帕拉图逝世，他移居小亚细亚，在这里主要从事生物学研究。他集古代科学之大成，后世生物学的发展，可以说是以他的发现为基础，他有关生物学的论述，至今被人们称赞。他在著作《自然之阶梯》中，已提出类似达尔文进化论的观点，关于发生和遗传提出了一些论据。他虽然未曾实行过人体解剖，但曾检验过不少动物的尸体。可以说，亚里斯多德开始了简单的比较解剖学。他曾以此详细论述了动物的内脏和器官，所使用的说明图，可以认为是最早的有记录的解剖图。他用于记录子宫的英文名称，被稍加改动沿用至今。他在解剖学方面，记述过动物“胃反刍”现象；对于某些鱼类也曾进行过较深入的研究；对于大静脉的分支和哺乳动臂部的表浅血管也留下相当准确的记载，且指出多数静脉与动脉相伴行；他还介绍了节肢动物的生殖器官和消化器官。尽管如此，亚里斯多德对生理学缺乏理解，不能将静脉与动脉作适当区别，也不能正确判断感觉器官、神经、脑髓间的关系。他错误认为脑髓不是重要器官，心脏才是重要器官，是感觉活动的根源。这一点很与古代中国的观念相似，也可能与埃及有关系。在亚里斯多德以前，柏拉图曾认为脑髓是思想、感觉的中心，而亚里斯多德则认内心脏是思维的中心。在他看来，脑仅起到冷却的作用，只是防止心脏过热罢了。他对发生学有着浓厚兴趣，而且以发生学为研究手段，进一步从事胎生学研究。他的最重要胎生学研究是以鸡雏做研究对象，这一选择是非常高明的。由于他的观察，人们才知道鸡卵在孵化日第3天即有所表现。亚里斯多德对于动物生殖的见解，一直影响到17世纪的哈维（W．Harvey 1578——1650）。从亚里斯多德生命观出发，生物与非生物的区别，在于精神、灵魂是否存在。他认为生物体内的精神是给予形态的东西，即先有精神，后有物质，是一种唯心主义观点。他曾给生命定义为“生命乃是自动营养、自动成长、自动死亡的力”。他认为生命要素有三种：最低是营养与繁殖，其次是感觉，最高是智力和精神。亚里斯多德物质构成的观点，同恩培多克勒相同，认为一切物质由四种元素构成：即土、水、火、风，以各字不同的比例结合而成不同的物质。四元素学说得到后人的继承和发展，化学家波一耳曾反复论述这种观点。亚里斯多德学派在生物学方面的贡献，由他的嫡子们继续发展。